Gamindustri ha entrado en una etapa siniestra y oscura conocida como el 
Período de Cambio de la CPU. Durante este tiempo de agitación social, los rumores de desaprobación sobre las CPUs han comenzado a saturar Gamindustri. Neptune y las otras chicas-consola creen que los ciudadanos pronto llamarán a nuevos líderes para reemplazar el ellos y que su dominio terminarán.
En estos momentos críticos para Planeptune, Neptune y Nepgear desaparecen misteriosamente. Su destino: un mundo divergente, cerca de un final catastrófico, la 
Dimensión Cero. Allí se encuentran con la última CPU que queda en ese mundo, UzumeTennouboshi, que está librando una batalla desesperada en solitario contra un mal colosal conocido como la 
CPU Oscura.
Neptune y Nepgear tienen que ser capaces de trabajar en equipo con Uzume para salvar la 
Dimensión Cero de la tragedia, y buscar nuevos aliados para su equipo. Afortunadamente también tendrán acceso a un nuevo poder, y a nuevas transformaciones. Así comienza una nueva aventura para Neptune...
En 
Gamindustri han entrado en un periodo oscuro, en el que hay un descontento general, y siniestros rumores sobre las 
CPU están en la boca del pueblo. Neptune y las otras están atemorizadas con la idea de que sean desplazadas por nuevos líderes... 
En esos momentos críticos para 
Planeptune, 
Neptune y Nepgear han desaparecido misteriosamente. Han sido transportada a un mundo divergente, cerca de un final catastrófico, la 
Zero Dimension. Allí encontrarán a la última CPU de ese mundo, 
Uzume Tennouboshi, quién sigue en solitario una batalla desesperada contra una malvada enemiga, conocida como la 
Dark CPU. 
Ahora, Neptune y Nepgear tendrán que unir sus fuerzas a la de Uzume para salvar la 
Dimensión Zero de la tragedia, empezando una nueva aventura... Cuyas repercusiones también se verán en su propio mundo.