El sistema jugable de NEO BERLIN 2087 se construye sobre una mezcla equilibrada entre investigación, acción directa, sigilo táctico y decisiones que influyen en el desarrollo de la historia. Esta combinación permite que cada situación se aborde de distintas maneras, adaptándose tanto a quienes prefieren avanzar con cautela como a quienes optan por enfrentamientos más contundentes.